4D tracking

Flagellenkinematik

Beschreibung

Eukaryotische Flagellen treiben Fortbewegung, Steuerung und Nahrungsströmungen in verschiedensten Systemen an und verknüpfen dabei molekulare Regulation mit dem Verhalten auf Zellebene. Die Quantifizierung dieses Zusammenhangs stellt ein 4D-Messproblem dar, da das biologisch relevante Signal die vollständige, sich zeitlich entwickelnde 3D-Wellenform ist, häufig bei Schlagfrequenzen von bis zu etwa 100 Hz. Die Erfassung dieser Dynamik erfordert eine ungewöhnliche Kombination aus hoher raumzeitlicher Auflösung, großem Probenvolumen und rechnerischer Effizienz. DHM® erfüllt diese Anforderungen, indem es die optische Wellenfront in einem einzelnen Hologramm aufzeichnet und eine numerische Refokussierung sowie volumetrische Rekonstruktion ohne mechanisches z-Scanning ermöglicht, wodurch eine skalierbare Grundlage für die 4D-Verfolgung von Flagellen geschaffen wird.

Einzigartige Vorteile des Lyncée Tec DHM®

  • Hohe zeitliche Auflösung: 194 Volumen/s (Standard-DHM®-Kamera) und bis zu 100.000 fps in der Hochgeschwindigkeits-DHM®-Konfiguration
  • Volumetrische Information in einer Einzelaufnahme: 3D-Volumen in einem Hologramm kodiert, rekonstruiert durch numerische Refokussierung (kein mechanisches z-Scanning)
  • Hohe Präzision: Submikrometer-genaue 3D-Lokalisierung mit etwa 50 nm axialer Präzision
  • Label-frei: Quantitative Phasenbildgebung ermöglicht Messungen ohne Farbstoffe und näher an natürlichen Bedingungen für Motilitätsstudien

Material und Methoden

  • Biologisches Modell: Reclinomonas americana
  • DHM® T1000 mit 4D-Tracking-Softwaremodul

Resulte

DHM® hat erstmals die direkte Quantifizierung der 3D-Bewegung der Flagelle eines phagotrophen Flagellaten ermöglicht und dabei stark nicht-planare Wellenformen in einem label-freien Workflow erfasst. Die Charakterisierung der Vielfalt flagellarer Wellenmuster liefert die quantitative Grundlage für ein mechanistisches Verständnis davon, wie Flagellaten pelagische Nahrungsnetze prägen, in denen Fortbewegung und Nahrungsströmungen Zielkonflikte zwischen Beuteerfassung, Nährstoffaufnahme, energetischen Kosten und Prädationsrisiko bestimmen.

Publiktionen

Precise 3D Tracking of Highly Non-planar Eukaryotic Flagellar Beating Patterns using Digital Holographic Microscopy

Patryk Nienaltowski, Jonasz Slomka, Federica Miano, Thomas Kiørboe, Clara Martínez-Pérez, Tristan Colomb, Yves Emery, und Roman Stocker

4D-Tracking der Flagelle von R. americana, dargestellt als Animation der 3D-Trajektorie (blaue Spur) und ihrer Projektion auf die XY-Ebene. Abtastrate: 200 Volumen/s.)

Reproduktionsbiologie

Beschreibung

Die Spermienmotilität ist ein wichtiger Biomarker in der Reproduktionsbiologie und Fertilitätsforschung. Eine präzise Analyse erfordert die Erfassung schneller dreidimensionaler Flagellenbewegungen zusammen mit komplexen Schwimmbahnen in räumlich eingeschränkten Umgebungen, eine Herausforderung, die mit konventioneller 2D-Mikroskopie nicht vollständig erfasst werden kann. DHM® ermöglicht label-freies 4D-Spermien-Tracking durch Single-Shot-Volumenbildgebung und eliminiert dabei mechanisches z-Scanning bei gleichzeitig hoher räumlicher und zeitlicher Auflösung über große Tiefenbereiche. Der Ansatz unterstützt die quantitative Analyse von 3D-Flagellenwellenformen, z-Bewegungen und Trajektorien-Chiralität in einem einheitlichen Workflow.

Einzigartige Vorteile des Lyncée Tec DHM®

  • Hohe zeitliche Auflösung: 194 Volumen/s (Standard-DHM®-Kamera) und bis zu 100.000 fps in Hochgeschwindigkeits-DHM®-Konfiguration
  • Einzelaufnahme-basierte volumetrische Information: 3D-Volumen in einem Hologramm kodiert, rekonstruiert durch numerische Refokussierung (kein mechanisches z-Scanning)
  • Hohe Präzision: submikrometergenaue laterale Auflösung und axiale (z) Auflösung im Nanometerbereich
  • Label-frei: Quantitative Phasenbildgebung ermöglicht Messungen ohne Farbstoffe, näher an natürlichen Bedingungen für Motilitätsstudien
  • Umfassende 4D-Motilitätsanalyse: Verknüpft das 3D-Schlagmuster mit der resultierenden 3D-Schwimmbahn, über 2D-Projektionen hinaus
  • Große Probentiefe für höheren Durchsatz: Holografische Rekonstruktion unterstützt größere Beobachtungsvolumina

Material und Methoden

  • Biologisches Modell: Maus-, Rinder- und menschliche Spermien
  • DHM® T1000 mit 4D-Tracking-Softwaremodul

Resultate

DHM® ermöglicht die quantitative 4D-Analyse der Spermienmotilität durch die Erfassung schneller 3D-Flagellenbewegungen zusammen mit komplexen Schwimmbahnen über die Zeit. Hochgeschwindigkeits-Holografie macht stark nicht-planare Wellenformen, wandernde z-Ebenen-Exkursionen sowie koordinierte Rollbewegungen sichtbar, die mit der Chiralität der Trajektorie verknüpft sind, und erschließt damit biomechanische Eigenschaften, die mit konventioneller Mikroskopie nicht zugänglich sind. Der Ansatz liefert neue Einblicke darin, wie Spermien Vortrieb erzeugen, torsionale Kräfte regulieren und während des Schwimmens eine chirale Erinnerung aufrechterhalten.

Publiktionen

Four-dimensional analysis by high-speed holographic imaging reveals a chiral memory of sperm flagella, PLOS ONE, Published: June 28, 2018

Michael Muschol, Caroline Wenders und Gunther Wennemuth

In dieser Animation wird die Flagellum-Bewegung eines Spermiums in 4D gezeigt. In Blau die Bewegung in XYZ, in schwarz die Projektion auf die XY, XZ und YZ Ebene. (Quelle PLOS ONE)

Lyncée Tec lieferte uns eine komplette Messanordnung bestehend aus DHM, Inkubationskammer und Fluoreszenzmodul, um einfach Aufnahmen von Spermien, ohne sie zu stören, machen zu können. Wie gezeigt erlaubt die 4D Tracking Möglichkeit des Lyncée Tec DHM-Mikroskops mit 194 Bildern/sec in hoher zeitlicher Auflösung die Aufzeichnung des Bahnverlaufs des Spermiums im Raum. In Kombination mit anderen Softwaretools sind wir damit in der Lage, innerhalb des Bildfelds mit der Lyncée Tec eigenen Tracking Software den gesamten Bahnverlauf exakt aufzuzeichnen. Dieses neue, einzigartige Messsystem ermöglicht uns den Zugang zu einem ganz neuen Forschungsfeld im Gebiet der männlichen Reproduktion.

Professor Gunther Wennemuth, Institute of Anatomy, Essen University Hospital, Germany
Animation der Bewegung im Raum eines frei schwimmenden Stier-Spermiums über die Zeit von 2.5 Sekunden. Der grüne Punkt bezeichnet den Kopf des Spermiums und die Pfad-Kolorierung die Bewegung in der Z-Achse. Die grüne, spiralförmige Animation zeigt den chiralen, sich im Uhrzeigersinn vorwärts bewegende Pfad, gezeigt links oben auch im Kreiskoodinatensystem. (Quelle PLOS ONE)

Mikrobielle Motilität

Beschreibung

Die mikrobielle Motilität spielt eine zentrale Rolle bei Prozessen wie Grazing, Chemotaxis, parasitärer Infektion und Umwelttransport. Eine präzise Charakterisierung erfordert das Tracking von Mikroorganismen in vollständig dreidimensionalen Umgebungen, in denen konventionelle 2D-Mikroskopie häufig nur projizierte Trajektorien oder Zellen innerhalb der Fokusebene erfasst. DHM® ermöglicht label-freies 4D-Mikroorganismen-Tracking durch Single-Shot-Volumenbildgebung und eliminiert dabei mechanisches z-Scanning, während skalierbare Analysen über große Tiefenbereiche unterstützt werden. Der Ansatz ermöglicht die quantitative Charakterisierung komplexer Schwimmbewegungen, 3D-Trajektorien und populationsbasierter Motilitätsdynamiken mit hoher räumlicher und zeitlicher Auflösung.

Einzigartige Vorteile des Lyncée Tec DHM®

  • Hohe zeitliche Auflösung: 194 Volumen/s (Standard-DHM®-Kamera) und bis zu 100.000 fps in Hochgeschwindigkeits-DHM®-Konfiguration
  • Einzelaufnahme-basierte volumetrische Information: 3D-Volumen in einem Hologramm kodiert, rekonstruiert durch numerische Refokussierung (kein mechanisches z-Scanning)
  • Hohe Präzision: submikrometergenaue laterale Auflösung und axiale (z) Auflösung im Nanometerbereich
  • Label-frei: Quantitative Phasenbildgebung ermöglicht Messungen ohne Farbstoffe, näher an natürlichen Bedingungen für Motilitätsstudien
  • Großes Probenvolumen für höheren Durchsatz: 5 mm × 5 mm × 0,2 mm (L×B×H), wobei der axiale Bereich durch Refokussierung numerisch leicht erweitert werden kann

Material und Methoden

  • Biologisches Modell: Vibrio coralliilyticus
  • DHM® T1000 mit 4D-Tracking-Softwaremodul

Resulte

DHM® ermöglicht quantitatives 4D-Tracking mikrobieller Motilität durch die Erfassung komplexer Schwimmbewegungen und schneller Reorientierungsereignisse in vollständig dreidimensionalen Umgebungen. Hochgeschwindigkeits-Holografie unterstützt robustes Tracking bei abrupten Richtungswechseln und schnellen Bewegungsänderungen und liefert gleichzeitig label-freie quantitative Phasenmessungen von Zellgröße und Morphologie. Die Rekonstruktion des vollständigen 3D-Volumens bewahrt zudem den räumlichen Kontext der Bewegung und macht nahegelegene Hindernisse, nicht-motile Zellen sowie Konfinierungsstrukturen zusammen mit den mikrobiellen Trajektorien sichtbar. Dadurch wird die direkte Untersuchung ermöglicht, wie lokale Mikroumgebungen das Schwimmverhalten und die Motilitätsdynamik beeinflussen.

Vibrio coralliilyticus Bakterien Tracks - die Darstellung zeigt die Tracks aller Bakterien während eines Zeitabschnitts. Interessant sind die beiden Tracks in Rot, die eine aktive Umorientierung von zwei Bakterien zeigen. Courtesy von Prof. Roman Stocker, Hydrodynamik und Grundwasser im Dept. Civil, Geomatic und Environmental Engineering, ETH Zürich.

“Wir haben zuerst mehrere andere Systeme zum Verfolgen von Bakterien probiert, und waren sehr positiv überrascht von der einfachen Bedienung und den unmittelbar vorliegenden Resultaten bei der Lyncée Tec Lösung”

Prof. Roman Stocker, Hydrodynamik und Grundwasser im Dept. Civil, Geomatic und Environmental Engineering, ETH Zürich.